Внесок Кохера в хірургію свідчить про нього, як про різнобічного хірурга. Він один з перших став проводити асептичне лікування ран. На посаді завідуючого кафедрою він виступив з пропозиціями щодо низьки питань клінічної хірургії. недостатньо розроблених до того часу, він був скурпульозний і вимогливий до наукових висновків. Під керівництвом Кохера виконано 122 дисертації (із них 32,8 % -російськими студентами та лікарямі). Він очолював кафедру хірургії Бернського університету протягом 91 семестр