Теодору Кохеру разом з Тіллінгом належить пріоритет в хірургічному лікуванні гострих запалень очеревини при проникаючих ранах живота і пошкодженні внутрішніх органів. Також Теодор Кохер запропонував доступ до селезінки, операції на товстої кишке (1874 р.), розробив чрездіафрагмальну лапаротомію. Теодором Кохером була розроблена операція вентріфіксації матки при її опущенні, операції при оваріотомії і гістеректомії, розрізи паховий при виддалені кили, розріз вздовж правого реберного краю.