Центральна нервова система (мозок) сприймає всі сенсорні дані, які ми отримуємо, і допомагає нам організувати, розставити пріоритети і зрозуміти інформацію. Майже у всіх дітей з аутизмом є порушення сенсорної інтеграції. Такі діти не можуть адекватно реагувати та обробляти інформацію, що надходить до них через аналізатори.
Дослідження науковців доказують, що проблема має фізичну природу: за нею стоїть вплив електричних імпульсів і хімічних речовин на мозок. Труднощі з навчанням чи поведінкою, викликані порушенням сенсорної інтеграції, - точно така ж фізична проблема, як, скажімо зламана нога або ангіна, саме тому на заняттях з ЛФК необхідно враховувати фізичну, а не психічну складову проблеми.
