В організації дослідного навчання можна виділити три етапи:
- Перший. Вчитель ставить проблему і окреслює шляхи вирішення, але саме рішення належить знайти учневі.
- Другий. Вчитель ставить проблему, але шляхи та методи її вирішення, а також саме рішення учневі потрібно знайти самостійно.
- Третій. Учні самі ставлять проблему, шукають шляхи її вирішення і знаходять саме рішення.