На Чорноморський заповідник покладено такі завдання: охороняти природу на заповідних териюріях, зокрема птахів лід час перельотів, зимівлі й гніздування; виявляти і вивчати дикорослі корисні рослини, зокрема люцерну серповидну, золотобородник цикадовий, види дикого льону для введення їх у культуру, а також спосіб закріплення токів і поліпшення малопродуктивних пасовищ.