Методичний матеріал розкриває основні принципи сучасної наукової класифікації організмів, яка відійшла від застарілих "штучних" систем, що ґрунтувалися виключно на зовнішній подібності. Сучасна класифікація, яку називають філогенетичною, базується на встановленні родинних зв'язків між організмами та їх еволюційною історією.
Центральною ідеєю є те, що всі види походять від спільних предків, а нове різноманіття виникає переважно шляхом дивергенції — розходження ознак у нащадків. Це призводить до утворення монофілетичних груп — таксонів, які включають усіх нащадків одного спільного предка. Важливим еволюційним процесом, що забезпечує різноманітність форм, є адаптивна радіація, коли види пристосовуються до різних умов існування.
