Викопні знахідки, які можуть мати відношення до бурих водоростей, датуються пізнім ордовиком (близько 450 млн років) і відомі як Winnipegia і Tallocystis із середнього силуру (425 млн років). Але ці знахідки не можна точно прив’язати тільки до бурих водоростей, так як вони схожі і з деякими сучасними зеленими та червоними водоростями. Викопні знахідки, які точно можна пов’язати з сучасними бурими водоростями, відносяться до міоцену (5-25 млн років). Це Zonarites і Limnophycus, що нагадують сучас