Одне з головних питань в дослідженні старіння - «що викликає старіння?». Незважаючи на багато досягнень і роки досліджень, відповідь на це питання залишається погано вивченим. Проте, був запропонований ряд теорій. Група теорій, відомих під загальною назвою гіпотези накопичення збитків, припускають, що старіння викликане накопиченням шкоди зі збільшенням віку. Найбільш широко прийнятої з цих теорій є вільнорадикальних теорія старіння (FRTA).
Ранні дослідження показали, що метилування ДНК відіграє вирішальну роль в процесі розвитку. Пізніші дослідження показали, що старіння є ключовим модулятором епігеномом. Епоха ДНКм Хорватії пропонує деякі цікаві ідеї в цьому відношенні (Хорват, 2013). З 353 сайтів CpG, використаних для прогнозування віку ДНКm, 193 були гіперметіліровани, а 160 - гіпометіліровани з віком, і більшість з них пов'язані з генами, які беруть участь в загибелі і виживання клітин, зростанні і проліферації клітин, розвитку організму і тканин і раку. Однак було також відзначено, що вік ДНКм не відображає клітинне старіння, оскільки він сильно корелює з хронологічним віком в коротких і довгоживучих клітинах, а також безсмертні клітини. Як і слід було очікувати, ембріональні стовбурові клітини, очевидно, мали вік ДНКм, близький до нуля.
