Агроекологі́чний моніто́ринг — частина системи екологічного моніторингу, що передбачає контроль за станом природно-господарського середовища сільськогосподарського призначення, виявлення екологічних ніш та об’єктів найбільшого впливу антропогенних негативних чинників.