Стародавні греки цю протоку називали «Геллеспонт», що в перекладі звучить як «море Гелли» і пов'язане з давньою легендою, яка свідчить, що у сина царя Еола (владики Еолійських островів) було двоє дітей – син Фрікс і дочка Гелла, які після смерті матері виховувалися злою мачухою Іно. Коли вони подорослішали, то нерідна мати вирішила погубити дітей свого чоловіка. Дочка і син царя намагалися врятуватися втечею на літаючому барану. Під час польоту Гелла, не втримавшись за золоту баранячу шерсть, впала в море і загинула. З тих пір воно носило її ім'я – «море Гелли». Сучасна назва протоку отримав завдяки місту Дарданія, яке колись стояло на березі протоки Дарданелли.
У 1810 році англійський поет Джордж Байрон переплив Дарданелли, і тим самим повторив подвиг давньогрецького героя Леандра, який щоночі перепливав протоку, щоб зустрітися зі своєю коханою Герой, що жила на протилежному березі. У 2010 році на честь цієї події відбувся масовий заплив по маршруту поета протяжністю 17 км, а з урахуванням заносу за течією – 5 км.