Великий Бар’єрний Риф налічує велику кількість мешканців – морські риби (1500 видів, серед яких і яскраві екзотичні риби-клоуни, риби-папуги й риби-метелики, мурени, 125 видів акул, в тому числі найбільша у світі – китова), безліч ракоподібних, восьминогів, 4000 видів молюсків, 17 видів морських змій, кілька видів китів, дельфіни, касатки, і навіть такий рідкісний ссавець як дюгонь -дальній родич морської корови. Дюгонь (від малайського duyung – «морська діва», «русалка») занесений до Міжнародної Червоної книги як вимираючий вид. Водиться тут і шість видів морських черепах.
Найбільший представник сімейства – зелена черепаха (її ще називають суповою), довжина тіла якої може досягати півтора метра, а вага 200 і більше кг. Велику популярність австралійська зелена черепаха знайшла через смачне м’ясо – основа для черепахового супу, тому цей вид серйозно постраждав від винищення і є рідкісним.