У складі Карпатського біосферного резервату є шість заповідних масивів (природних ядер): Чорногірський, Свидовецький, Марамороський, Кузій-Трибушанський, Угольсько-Широколужанський і Долина нарцисів та 2 ботанічні заказники: "Чорна Гора" і "Юлівська Гора". Ці масиви розташовані на висоті від 180 до 2061 м над р. м. і вони практично повнiстю репрезентують ландшафтне та бiогеографiчне рiзноманiття Схiдних Карпат. Тут представленi малопорушені та практично незачеплені людською діяльністю передгiрні дiброви, гiрські букові, мiшані та смерекові лiси, субальпiйські та альпійські луки з сосново-вiльховим криволiссям і скельно-лишайниковими ландшафтами; майже 90% території заповідника вкрито лiсами – переважно пралiсами.
У заповiднику вiдмiчено 307 видів флори i фауни, занесених до Червоної книги України, також багато видів занесені до міжнародних Червоних списків.